Vacature Student voor analyse transcriptoom data (RNAseq) i.r.t. lange-termijn uitkomsten

Werkomgeving

Sepsis komt veel voor, is potentieel dodelijk en toch een vrij onbekende aandoening. Circa ťťn op de vijftig ziekenhuisopnames is vanwege sepsis, waarbij circa ťťn op de vijf komt te overlijden in het ziekenhuis. PatiŽnten die sepsis overleven krijgen vaak te maken met blijvende fysieke en mentale klachten, een grotere kans op hart- en vaatziekten en een hogere kans hieraan te overlijden. Wat deze lange termijn gevolgen precies veroorzaakt is nog onbekend en moeilijk te achterhalen. Er komt steeds meer aandacht voor het indelen van patiŽnten op basis van genexpressie patronen tijdens sepsis via transcriptoom analyse. We bepalen hiermee de complete set van RNA transcripten en op basis daarvan kunnen we patiŽnten in verschillende genexpressie profielen (moleculaire endotypes) indelen. De verschillende moleculaire endotypes zijn geassocieerd met een verschillend risico op IC-opname of overlijden tijdens sepsis. Het is echter niet bekend of deze moleculaire endotypes ook associŽren met de uitkomsten op lange termijn, na ontslag uit het ziekenhuis.

We willen daarom RNA sequencing/transcriptoom data van sepsis patiŽnten analyseren, met als doel:

  • inzicht krijgen in het genexpressie profiel van ons cohort van patiŽnten met sepsis;
  • inzicht krijgen in de rol van de verschillende genexpressie profielen op de lange-termijn mortaliteit;
  • koppelen van deze genexpressie profielen met kwaliteit van leven voor en na sepsis.

Functiebeschrijving Je begint met een literatuuronderzoek naar de moleculaire endotypes van sepsis en het inventariseren van lange-termijn uitkomsten. Vervolgens onderzoek je met (reeds beschikbare) RNA sequencing data welk moleculair endotype tijdens sepsis associeert met kwaliteit van leven en sterfte op de lange-termijn na sepsis. De bevindingen willen we verwerken in een artikel voor een wetenschappelijke publicatie. Wat vragen wij

  • Een WO-Master opleiding zoals bio-informatica, medische of moleculaire biologie.
  • Je kan omgaan met SPSS en R of bent bereid je hier in te verdiepen.
  • Je beschikt over goede sociale en communicatieve vaardigheden die je naar gelang het contact op een correcte wijze gebruikt.
  • Je bent creatief en hebt frisse ideeŽn, ook binnen gestelde kaders.
  • Je beschikt over goede schriftelijke vaardigheden.
  • Je bent ambitieus en wilt graag nieuwe dingen leren.

Wat bieden wij

  • Stageovereenkomst met het UMCG.
  • Goede begeleiding in het UMCG.
  • Inbedding in het acute wetenschappelijke onderzoek (o.a. Acutelines).
  • Wetenschappelijke werkomgeving.
  • Nestor: een omgeving speciaal voor afstudeerders met informatie, links, tips & trics die je kunnen helpen tijdens je afstudeerperiode in het UMCG.

NB: Vanwege de COVID-19 situatie werk je grotendeels vanuit huis aan deze opdracht en voer je alleen in goed overleg met de opdrachtgever bepaalde taken in het UMCG uit.

Meer informatie Neem voor meer informatie contact op met:
afstuderen@umcg.nl
Solliciteren Solliciteren kan uitsluitend via het digitale sollicitatieformulier onderaan deze pagina. Binnen een half uur na het verzenden van het digitale sollicitatieformulier wordt een ontvangstbevestiging gemaild met nadere informatie. Genoemde uiterste reactiedatum in het vacatureoverzicht is niet van toepassing op deze vacature. De vacature blijft op de website staan totdat een geschikte student is gevonden voor deze opdracht.
Universitair Medisch Centrum Groningen

Algemene gegevens vacature

Organisatie Universitair Medisch Centrum Groningen

Vacature Student voor analyse transcriptoom data (RNAseq) i.r.t. lange-termijn uitkomsten

Plaats Groningen

Provincie Groningen

Vacature geplaatst

Gegevens organisatie

Naam Universitair Medisch Centrum Groningen

Adres Hanzeplein 1 9713 GZ Groningen

Vergelijkbare vacatures

Geen vergelijkbare vacatures gevonden.